Для установки сервера MTA используйте ftp. Для начала войдите в раздел: Управление - Настройки и если Вам необходимо отредактируйте файл конфига, обязательно Сохраните! Далее войдите в FTP , в корень сервера, за тем закиньте все папки и файлы заменив имеющиеся. Не удаляйте файл mta-servers, это файл запуска сервера, удалив его сервер не запуститься!
В случае не успешной установки своей сборки, переустановите сервер на стандартный в разделе - Переустановка - Выбор версий. Сервер будет переустановлен на стандартный автоматически.

Внимание! Если вы вставили свои данные, обязательно удалите вверху и внизу иначе сервер не запустится!!!

Также у Вас имеется возможность восстановить конфиг сервера на "стандартный", коикнув по кнопке "раскрыть содержимое", скопировать стандартный конфиг и вставить вместо старого ниже.